L'UNESCO ha designato una serie di siti associati alla storia a scacchi dei cristiani nel Giappone dal XVI al XIX secolo come il 16 ° sito del patrimonio culturale mondiale del paese. Il "sito" è composto da 19 villaggi nel Kyushu nord-occidentale, così come le rovine del castello di Hara - originariamente costruito dai portoghesi - e la cattedrale di Santa Maria dell'Immacolata Concezione nella città di Nagasaki.
Poiché la pratica del cristianesimo fu vietata in Giappone fino al 1873, i cristiani (noti come Kakure Kirishitan) adoravano - ei missionari diffondevano il Vangelo - in segreto. Sono le chiese "segrete" dei siti nei remoti villaggi "cristiani" della costa e nelle isole isolate che sono la componente principale del riconoscimento dell'UNESCO. Le rovine del castello di Hara sono un altro elemento, poiché veniva utilizzato dai missionari portoghesi e olandesi.
Uno degli esempi più visibili della designazione dell'UNESCO è la Cattedrale cattolica romana di Santa Maria di Nagasaki, conosciuta anche come la Cattedrale dell'Immacolata Concezione, costruita nel 1914 dopo che il divieto del cristianesimo fu revocato. La cattedrale originale fu distrutta dalla bomba atomica caduta su Nagasaki nell'agosto 1945 e una replica dell'originale fu consacrata nel 1959. Statue e manufatti danneggiati dal bombardamento, inclusa una campana dell'Angelus francese, sono ora esposti sul terreno (e presso la Cattedrale dell'Immacolata Concezione). Il vicino Parco della Pace contiene resti delle mura della cattedrale originale. La chiesa di Oura è un'altra chiesa cattolica a Nagasaki. Costruita verso la fine del periodo Edo nel 1864 da un missionario francese per la crescente comunità di mercanti stranieri nella città, è considerata la chiesa cristiana più antica del Giappone e uno dei più grandi tesori nazionali del paese.
Storicamente, Nagasaki è stata a lungo l'ingresso iniziale per gli stranieri in Giappone. Fu a Nagasaki nel 1859, dopo che il Commodoro Perry degli Stati Uniti usò la diplomazia delle cannoniere per chiedere la fine della politica di isolamento del Giappone di oltre 200 anni, che i diplomatici di paesi di tutto il mondo giunsero a chiedere che il porto fosse aperto a commercio. Successivamente, l'imperatore Meiji dichiarò Nagasaki un porto franco nel 1859. Ed è stata Nagasaki l'ambientazione del romanzo del 1898 di John Luther Long, Madame Butterfly, che, nel 1904, fu trasformato in un'opera di Giacomo Puccini, e rimane uno dei le opere più amate.
