Nuova ricerca per i pazienti con cancro del colon-retto

Caris Life Sciences® presenterà risultati che forniranno una comprensione più approfondita del fatto che l'espressione tumorale dei geni correlati all'entità dell'esposizione al farmaco, stratificata per stato di p53, è associata agli esiti clinici sui comuni regimi chemioterapici utilizzati per il trattamento del cancro del colon-retto metastatico (CRC). Questi risultati saranno presentati alla riunione annuale 2022 dell'American Association for Cancer Research (AACR) che si terrà dall'8 al 13 aprile 2022 a New Orleans, Louisiana.

La ricerca con il poster intitolato "Firme genetiche indotte da farmaci prognostici e predittivi per i pazienti con cancro del colon-retto personalizzate in base allo stato di p53 e al trattamento con FOLFOX, 5-FU, oxaliplatino o irinotecan" (Abstract n. 1231), è stata guidata da Wafik El-Deiry , MD, Ph.D., FACP, Direttore del Legorreta Cancer Center della Brown University, Associate Dean presso la Warren Alpert Medical School, membro della Precision Oncology Alliance (POA) di Caris. Il POA di Caris è una rete in crescita di importanti centri oncologici in tutto il mondo che collaborano per far progredire l'oncologia di precisione e la ricerca basata sui biomarcatori. Questo lavoro è stato presentato a New Orleans da Lindsey Carlsen, una studentessa laureata in Patobiologia nel laboratorio EL-DEIRY di Brown.

L'obiettivo di questo studio era identificare i biomarcatori predittivi per le chemioterapie utilizzate nel CRC. Lo studio ha utilizzato linee cellulari CRC per identificare geni differenzialmente espressi dopo il trattamento con 5-fluorouracile, irinotecan o oxaliplatino e ha stratificato le firme in base allo stato di p53. Da questi studi in vitro, i ricercatori hanno quindi esaminato se questi geni e le firme geniche potessero predire gli esiti dei pazienti con CRC dopo la chemioterapia (FOLFOX, 5-fluorouracile, irinotecan o oxaliplatino). 2,983 campioni di pazienti CRC p6,229 wild-type e 53 con perdita di funzione sono stati analizzati mediante sequenziamento di nuova generazione di DNA/RNA presso Caris Life Sciences. I risultati della sopravvivenza nel mondo reale sono stati dedotti dai dati sui sinistri assicurativi e dalle stime di Kaplan-Meier. Sia l'espressione genica prognostica che quella non prognostica hanno avuto un effetto significativo sugli esiti di sopravvivenza a seguito di trattamenti farmacologici specifici.

"Questo studio ci aiuta a capire l'importanza che le firme geniche hanno nel dimostrare una maggiore capacità predittiva rispetto alle singole trascrizioni", ha affermato El-Deiry. "Collegando la ricerca di base e clinica, questa ricerca ci consente di capire meglio quali terapie hanno maggiori probabilità di avvantaggiare i pazienti con CRC". Lo studio ha scoperto che l'espressione tumorale dei geni correlati all'esposizione ai farmaci può predire i risultati dopo il trattamento chemioterapico:

• Elevati mRNA di EGR1 e FOS predicono indipendentemente la risposta a FOLFOX nei pazienti con tumori p53 wild-type.

• Un basso mRNA di CCNB1 è correlato a una buona prognosi dei pazienti con CRC con tumori che presentano mutazioni con perdita di funzione di TP53.

• La bassa espressione di BTG2 predice una prognosi migliore nei pazienti con tumori MSI-High TP53 mutati.

• Le firme geniche possono dimostrare una maggiore capacità predittiva rispetto agli effetti della trascrizione individuale.

"Caris si concentra su biomarcatori in grado di predire la risposta del paziente alle terapie più recenti, ma anche su chemioterapie collaudate come FOLFOX", ha affermato W. Michael Korn, MD, Chief Medical Officer di Caris. "Siamo entusiasti di vedere la capacità di ricerca traslazionale potenziata dagli straordinari dati multi-omici e dagli strumenti analitici che Caris ha sviluppato e continua a fare progressi".

Il profilo molecolare completo di Caris valuta l'intero esoma (DNA), l'intero trascrittoma (RNA) e l'espressione proteica, fornendo una risorsa impareggiabile e il percorso ideale per condurre la ricerca traslazionale per accelerare la scoperta per il rilevamento, la diagnosi, il monitoraggio, la selezione della terapia e lo sviluppo di farmaci per migliorare la condizione umana.

Caris presenterà ulteriori dati provenienti da studi che dimostrano il ruolo fondamentale della medicina di precisione e della profilazione molecolare nel trattamento del cancro. Tutte le presentazioni saranno rese disponibili online attraverso il sito web di Caris a partire dall'8 aprile 2022.

Presentazioni aggiuntive rivelano l'impatto della profilazione molecolare completa e la potenziale attuabilità clinica

• Caratterizzazione completa delle alterazioni di FGF/FGFR nei tumori mammari invasivi (Abstract #5793) La segnalazione di FGFR è fondamentale per la proliferazione, la migrazione, l'angiogenesi e la sopravvivenza delle cellule tumorali; Le alterazioni dell'FGFR sono diventate clinicamente attuabili in un numero crescente di tipi di cancro. Questo studio ha valutato l'incidenza e la caratterizzazione di numerose alterazioni di FGF/FGFR in oltre 12,000 tumori mammari invasivi e ha evidenziato l'enorme eterogeneità delle alterazioni di FGF/FGFR in vari sottotipi istologici e molecolari, nonché in diversi siti metastatici di cancro al seno. Inoltre, le associazioni delle alterazioni dell'FGFR e della resistenza alle terapie sono state mostrate in un ampio database clinico con risultati molecolari abbinati.

• Caratteristiche genomiche e immunitarie dei sottotipi di EGFR nel carcinoma polmonare non a piccole cellule (NSCLC) (Abstract #4119) Mentre i tumori NSCLC mutanti di EGFR generalmente sono resistenti agli inibitori di PD-1/PD-L1, un piccolo sottogruppo di pazienti può avere risposte durature . I tumori con mutazione dell'EGFR dimostrano una significativa eterogeneità molecolare, tuttavia, vi è una mancanza di chiarezza sui profili genomici e immunitari dei sottotipi di mutazione dell'EGFR e un'ulteriore delucidazione di ciò potrebbe aiutare a identificare i pazienti che potrebbero rispondere alle terapie immunitarie. Sfruttando i dati molecolari multi-omici generati dal sequenziamento di nuova generazione di DNA e RNA su un'ampia coorte di tumori NSCLC, questo studio conferma la diminuzione dell'immunogenicità associata alla maggior parte dei sottotipi di mutazioni di EGFR manifestate da biomarcatori tra cui PD-L1, TMB e CD8+ T infiltrazione cellulare; e rivela rare mutazioni dell'EGFR associate a un profilo immunitario favorevole che possono suggerire una reattività alla terapia immunitaria.